ワコムの設定ツールを開いて、「ペン」タブ>「マッピング」ボタン>「デジタルインク機能を使う」のチェックを外してみてください。
（現状、ストロークはできるようになることが確認されています。ペンボタンはうまく動作しない可能性があります）
※Windows Inkに対応した際、設定を戻す必要があります。
なお、回転、水平パンはBAMBOOのペンタブレット本体（板タブ）の方のボタンに右クリック、中央クリックを割り当てることで対応可能です。ズームは、マウスのホイールで行ってもらうか、タッチ対応のBAMBOOならタッチ操作でズームできるようです。
※本内容は、開発者がBAMBOO CTH-460で確認した内容です。他の型番等では不具合が解消されない場合がございます。その場合はバグ報告フォームより報告をお願いいたします。